参考:https://www.rosettacommons.org/demos/latest/tutorials/scoring/scoring 介绍 Rosetta有一个被称为ref2015的优化能量函数或打分函数,用于计算由L-氨基酸组成的球状蛋白质中所有原子相互作用的能量。还有...
介绍 参考:https://www.rosettacommons.org/docs/latest/rosetta_basics/file_types/resfiles resfile包含输入到PackerTask并控制Packer的信息。简单来说,就是指定了程序运行时对特定氨基酸进行特定设计。 ALLA...
cst(constraint file)文件示例: CST::BEGIN TEMPLATE:: ATOM_MAP: atom_name: C6 O4 O2 TEMPLATE:: ATOM_MAP: residue3: D2N TEMPLATE:: ATOM_MAP: atom_type: Nhis, TEMPLATE:: ATOM_MAP: ...
1.Rosetta uses SCons as a compile assistant. You will likely need to download and install this first. download website: http://www.scons.org/download.php install comman...
在执行多线程编译rosetta时执行: python scons.py bin mode=release extras=mpi -j8 编译安装rosetta 会出现错误sh: mpiCC command not found导致编译终止。 解决方法: 1.首先确定已安装openmpi,不管你...
Purpose: 主要说目的,relax的作用就是对一个给定的蛋白进行构象搜索,寻找与WT相似并能量低于WT的结构,既包含packer又包含minimizer。主要的应用在对一个结构构象进行取样,获得一个构象assembly,同时还能...