rosetta Resfile语法和约束

2023-04-20,,

介绍

参考:https://www.rosettacommons.org/docs/latest/rosetta_basics/file_types/resfiles

resfile包含输入到PackerTask并控制Packer的信息。简单来说,就是指定了程序运行时对特定氨基酸进行特定设计。

ALLAA: 设计为包含半胱氨酸的20种氨基酸,与ALLAAwc相同

ALLAAwc: 默认情况,设计为所有20种氨基酸

ALLAAxc: 设计为除半胱氨酸以外的其他氨基酸

POLAR: 设计为典型极性氨基酸

APOLAR: 设计为非极性氨基酸

PIKAA <list of AAs> : 设计为特定氨基酸,如PIKAA DNTP,表示将氨基酸设计为DNTP

NOTAA <list of AAs>: 不设计为指定氨基酸,如NOTAA DNTP

rosetta Resfile语法约束的相关教程结束。

《rosetta Resfile语法和约束.doc》

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